2002年9月被省政府批准设立为省级高新技术产业开发区。2003年2月被批准成为国家火炬计划生物技术产业基地。2004年12月28日禹城高新区通过省政府认定，正式挂牌，成为全省唯一一家设在县级市的省级高新区。2005年，以禹城高新区“功能糖产业”为依托，禹城市摘取“中国功能糖城”桂冠。 是山东省唯一一家设在县一级的省级高新技术产业开发区。1999年3月正式启动建设，2003年2月，被科技部批准建立国家火炬计划禹城生物技术产业基地。高新区位于禹城市区东部，京沪铁路、济邯铁路、京福（沪）高速公路、青银高速公路、308国道、101和316省道穿境而过。规划面积7平方公里。已开发并建成面积 6平方公里。区内拥有完善的水、电、热、路、通讯等基础设施，实现了“七通一平”。区内海关监管仓库、中专、技校、中小学、幼儿园、医院、商住区等功能区一应俱全。 经过几年的发展，高新区初步形成了以功能糖、生物制药、羊绒精纺、机械制造等为主的“三糖一药一机一木一‘黄金’”高新产业群体，产业体系完善，高新技术特色明显。目前，入区项目已达127家，其中省级以上高新技术企业已达17家，国家级高新技术企业5家，拥有山东省著名商标6个，山东名牌2个，4个项目被列入了国家“ 863” 计划。25家企业生产出35种高新技术产品，其中有3种居国际领先水平，12种达到国际先进水平。